Os Arquivos Históricos tem sob sua guarda fundos e/ou coleções públicos e privados.
Com o objetivo de recuperar e preservar a memória científica nacional, preservamos também, as conferências, seminários e colóquios realizados e/ou co-organizados pelo CLE. Dentro dessa política os Arquivos Históricos guardam 55 cópias das entrevistas realizadas no contexto do projeto "História da ciência no Brasil", desenvolvido entre os anos de 1975-1978 e coordenado por Simon Schwartzmann. Destacamos, entre outros: Bernard Gross, Paulus Aulus Pompeia, Sérgio Porto e Zeferino Vaz.
A pesquisa ao acervo pode ser feita através da aplicação AtoM.
| Públicos | Privados (Pessoais/Associações) |
| Centro de Lógica, Epistemologia e História da Ciência (CLE) | Allyrio Hugueney de Mattos |
| Comissão Supervisora do Planos dos Institutos (COSUPI) | Antonio Mário Antunes Sette |
| Programa de Expansão do Ensino Tecnológico (PROTEC) | Ayda Ignez Arruda |
| Associação Nacional de Pós-Graduação em Filosofia (ANPOF) | Cesare Mansuetto Lattes |
| Hugo Régis dos Reis | |
| Itala Maria Loffredo D'Ottaviano | |
| Joaquim da Costa Ribeiro | |
| José Carlos Valladão de Mattos | |
| Leônidas Hegenberg | |
| Leopoldo Nachbin | |
| Luiz Muniz Barreto | |
| Mário Schenberg | |
| Michel Maurice Debrun | |
| Michael Beaumont Wrigley | |
| Newton Carneiro Affonso da Costa | |
| Sérgio Pereira da Silva Porto | |
| Sociedade Brasileira de Lógica (SBL) | |
| Walter Hugo de Andrade Cunha |